福建地区肺癌患者EGFR基因突变的研究
Amoydiagnostics Co.,LTD. / 2009-10-14
福建地区肺癌患者EGFR基因突变的研究—一种新的实时PCR方法与传统测序法的比较
福建省肿瘤医院、厦门市第一医院、中国人民解放军174医院、厦门艾德生物医药科技有限公司
收集临床肺癌(含大、小细胞癌)肿瘤石蜡切片样本346例(福建省肿瘤医院、厦门市第一医院、中国人民解放军174医院),以ADx-EGFR实时PCR(艾德公司)和Sanger DNA测序法同时检测EGFR基因外显子18、19、20、21的突变率和突变类型的数目。
结果:ADx-EGFR实时PCR对346例样品检测都得到了清晰明确的结果,检测成功率为100%,Sanger测序成功检测了326例,成功率为94.2%。346例肺癌样品中实时PCR检测82例突变,突变率为23.7%,Sanger测序成功的样品326例,检测突变41例,突变率为12.6%。与测序法比较,实时PCR的突变检测一致率为:100%,野生型检测一致率为:87.8%,总体检测一致率为:88.8%。配对χ2检验,χ2=3208.45,P<0.01,按α=0.05水平,差异有统计学意义,可认为两种检测方法的突变检测结果有差异,艾德试剂检测突变率较高。
结论:采用ADx-EGFR实时PCR方法检测的福建地区肺癌(含大、小细胞癌)中EGFR基因突变率与其他研究报道接近,明显高于Sanger测序法检测出的EGFR突变率(P<0.01)。在肺癌组织中主要以外显子19缺失和外显子21上的L858R的点突变为主,其余的突变较为少见。对于福尔马林固定石蜡包埋样品而言,ADx-EGFR实时PCR对样品的DNA质量的耐受性较好,检测成功率高于Sanger测序。而且ADx-EGFR实时PCR仅一步操作,闭管检测,无污染,90分钟即可判断结果,而Sanger测序法步骤繁琐,易污染,耗时久。因此,ADx-EGFR实时PCR具有很好的临床实用性,将可能代替Sanger测序法作为临床上对肿瘤EGFR基因体细胞突变检测的普遍方法。